Berikut trayek kapal perintis yang sudah ada melayani masyarakat Tual adalah sbb:
1. R-54
Tual – 28,5 – Tayando – 15,9 – Tam – 14,2 – Fadol – 6,2 – Mangur – 17,3 – Kur – 7,8 – Kaimer – 7,8 – Kur – 17,3 – Mangur – 6,2 – Fadol – 14,2 – Tam – 15,9 – Tayando – 28,5 – Tual – 24,5 –– Elat – 14,9 – Mun – 26 – Banda Eli – 6,3 – Holat – 67 – Dobo – 129,4 – Kaimana – 129,4 – Dobo – 67 – Holat – 6,3 – Banda Eli – 26 – Mun – 14,9 – Elat – 24,5 – Tual / KM. PAPUA SATU / KM. MIYAJIMA
2.R-55
Tual – 28,5 – Elat – 189,2 – Saumlaki – 83,7 – Marsela – 26 – Wetan/Herley – 3 – Tepa - 100 – Moa – 60 – Romang – 35 - Kisar/Wonreli – 35 – Romang – 60 –Moa – 100 – Tepa – 3 – Wetan/Herley - 26 – Marsela – 83,7 – Saumlaki – 189,2 - Elat – 28,5 – Tual. / KM. TIMOTI
3. R-56
Tual – 105,4 – Molu – 34,7 – Larat – 35 – Wunlah – 83 – Saumlaki – 83 – Wunlah – 35 – Larat – 34,7 – Molu – 110 – Tual -24,5 - Elat 99,7, Dobo – 39 - Marlasi -66- Kojabi -60- Warabal -27- Baimun -40- Meror – 110 - Dobo - 99,7 - Elat -24,5 - Tual / KM. INTI GLORY
4. R-57
Tual – 28,5 – Tayando – 35 – P.Kur – 7,8 – Kaimer – 36 - Teor - 17– Kesui – 32,5 – Gorom – 34 – Geser – 65 – Bula – 108,5 – Fak-Fak – 108,5 – Bula – 65 – Geser – 34 – Gorom – 32,5 – Kesui – 17 - Teor - 36 – Kaimer – 7,8 – P.Kur – 35 – Tayando – 28,5 – Tual – 24,5 – Elat – 42,5 – Banda Eli/Holat – 67 – Dobo – 67 – Banda Eli/Holat – 42,5 – Elat – 24,5 – Tual./ KM. MITRA BERSAMA
5.R-58
Tual – 192,2 – Banda – 128,7 – Ambon – 128,7 – Banda – 192,2 – Tual – 24,5 – Elat – 99,7 – Dobo -99,7- Elat – 24,5- Tual – 119,5 – Larat – 95,5 – Saumlaki – 104,7 – Tepa – 104,7 – Saumlaki – 95,5 – Larat – 119,5 – Tual/ KM. SANUS 60
6. R-111
Tual – 108,7 – Dobo - 39 - Marlasi – 158 – Pomako – 158 – Marlasi - 39 - Dobo – 108,7 – Tual – 105,4 – Molu – 34,7 – Larat – 95,5 – Saumlaki – 83,7 – Marsela – 15,7 – Kroing/ Letwurung – 15,7 - Marsela – 83,7 – Saumlaki – 95,5 – Larat- 34,7 – Molu – 105,4 – Tual/ KM. CAHAYA MANGGALA