Kantor Kesyahbandaran dan Otoritas Pelabuhan Kelas IV Kalabahi mempunyai   tugas melaksanakan pemberian pelayanan lalu  lintas dan  angkutan laut, keamanan  dan keselamatan pelayaran  di perairan pelabuhan untuk memperlancar angkutan laut.

Dalam melaksanakan tugas dimaksud di atas Kantor Kesyahbandaran dan Otoritas Pelabuhan Kelas IV Kalabahi menyelenggarakan fungsi :

1. Pengawasan  kegiatan   lalu  lintas  angkutan  laut  yang  meliputi  lalu lintas kapal, barang, hewan, container dan pemantauan pelaksanaan tarif.

2. Pembinaan  Tenaga  Kerja Bongkar Muat  (TKBM)  dan pemantauan pelaksanaan tarif.

3. Penilikan  terhadap  pemenuhan  persyaratan Kelaiklautan Kapal dan pengeluaran Surat Persetujuan Berlayar (SPB).

4. Pelaksanaan tindakan pencegahan dan penanggulangan pencemaran serta pemadam kebakaran di perairan Pelabuhan dan Bandar.

5. Pelaksanaan  pengamanan,  penertiban,  penegakan peraturan  di bidang  pelayaran dan  tindak  pidana pelayaran  diperairan  Pelabuhan dan  perairan Bandar  guna menjamin kelancaran operasional pelabuhan.

6. Pengawasan  kelaikan dan  keselamatan   fasilitas  dan peralatan pelabuhan,  alur  pelayaran    dan   kolam  pelabuhan   serta pengawasan   pembangunan   fasilitas pelabuhan penilikan kinerja operasional pelabuhan.

7. Pelaksanaan pemeriksaan  nautis, teknis, radio, peralatan, pencegahan, pencemaran pembangunan dan  perombakan  kapal  serta verifikasi  manajemen keselamatan kapal dan penerbitan sertifikat, surat kebangsaan  dan hipotik kapal.

8. Pelaksanaan  pengukuran  dan   status hukum  kapal, surat kebangsaan  kapal  dan Hipotik    kapal  serta pengurusan   dokumen pelaut,   penyijilan  awak  kapal dan penyijilan kerja laut.

9. Pelaksanaan urusan administrasi dan kerumah tanggaan.