Distrik Navigasi Tipe A Kelas III Tanjung Intan mempunyai tugas melakukan perencanaan, pengoperasian, pengadaan dan pengawasan  sarana bantu navigasi pelayaran, serta kegiatan pengamatan alur, survey hidrografi, pemantauan alur dan perlintasan dengan menggunakan sarana instalasi untuk kepentingan keselamatan pelayaran.

Dalam melaksanakan tugasnya Distrik Navigasi Tipe A Kelas II Tanjung Intan menyelenggarakan fungsi:

1. Penyusunan rencana dan program pengoperasian, serta pengawasan sarana bantu navigasi pelayaran, telekomunikasi pelayaran, kapal negara kenavigasian, fasilitas pangkalan, bengkel, pengamatan laut dan survey hidrografi serta pemantauan alur dan perlintasan;
2. Penyusunan rencana kebutuhan dan pelaksanaan pengadaan, penyimpanan, penyaluran dan penghapusan perlengkapan dan peralatan untuk sarana bantu navigasi pelayaran, telekomunikasi pelayaran, kapal negara kenavigasian, fasilitass pangkalan, bengkel, pengamatan laut dan survey hidrografi, serta pemantauan alur dan perlintasan;
3. Pelaksanaan program pengoperasian dan pemeliharaan sarana bantu navigasi pelayaran, telekomunikasi pelayaran, kapal negara kenavigasian, fasilitass pangkalan, bengkel, pengamatan laut dan survey hidrografi, serta pemantauan alur dan perlintasan.